农业局内设办公室、人事劳动科、计划财务科、综合法规科；下设农技站、农经站、种子站、经作站、土肥站、植保植检站、农广校、科教培训站、农技中心、农村能源办公室、旱地农业办公室、农产品检测中心；下属种子公司、农科所、植保公司、原种场、园艺场、蚕种场6个二级机构。

    近几年来，农业局党组以党的十六大精神为指导，认真实践“三个代表”重要思想，积极大胆探求林州农业发展的新路子。以项目为依托，不断加大农业科技含量，大搞技术人员“上挂专家下联群众”的科技入户活动，引导农民走科技发展的道路。按照“因地制宜、群众自愿、依托市场、搞好示范”的调整思路，积极发展小杂粮和蔬菜生产，重点发展中药材产业化生产。2004年，全市人均农民纯收入达到3325元，粮食播种面积100万亩，总产23.8万吨；优质小杂粮种植面积达到了6万亩；商品蔬菜面积增加到了6万亩；中药材面积由2001年的9000亩发展到5万亩。